הקשר הראשון בין ״מחשבות״ לפרופ׳ ליבוביץ נוצר בגיליון 18, שראה אור באוגוסט 1966, בראיון איתו ועם הסופר אהרון מגד על מדע ומוסר… פרופ׳ ליבוביץ לא הסתפק בזכות ראשונים, וער מהרה הפך אורח קבוע ב״מחשבות״. מעל עמודיו פתח בפולמוס מרתק על אפשרויותיו ומגבלותיו של המחשב האלקטרוני כמודל של המוח ושל החשיבה, הציג את הבעיה הפסיכופיסית, הבחין בין מכניזמים הפועלים בחיים ובין החיים עצמם, ותיאר את הזיקות בין “מדינה, עם ואדם”…